六十八岁时，在弟子冉秋努力下被迎回鲁国，虽然被敬称为“国老”，国君与三桓时常请教于他，但是依旧是“敬而不用”。
当时天下公学把持舆论，只有贵族可以学礼仪，明典籍，孔子率先开始教授私学，以至于弟子多达三千人，其中贤人七十二。
晚年，孔子垂垂老矣，又不得重用，于是专注于修改注释经典，修《诗》《书》，定《礼》《乐》，序《周易》，改《春秋》。
在改《春秋》时，鲁哀公十四年，西狩于大野。
叔孙氏家臣钥商获麟，折其左足，载以归。叔孙氏以为不祥，弃之郭外，使人告孔子曰：“有麋而角者何也？”
孔子往观之曰：“麟也，胡为乎来哉。”夫子反袂拭面，涕泣沾衿。
叔孙氏闻之，然后取之。
弟子子贡问曰：“夫子何泣也？”
孔子曰：“麟之至为明王也，出非其时而见害，吾是以伤之。”
因为思及自己出生时有麒麟现世，如今无端麒麟被杀，孔子认为大不详，于是停止修改《春秋》。
并写下挽歌：唐虞世兮麟凤游，今非其时来何求？麟兮麟兮我心忧。此乃“获麟绝笔”之典故是也。
不久，其长子孔鲤早逝，哀而成疾，与世长辞，临死前悲呼“太山怀乎梁柱摧乎哲人萎乎？”
弟子子贡守灵六年，门人弟子聚集坟冢之处守孝，筑室而居，号称“孔里”。
周天星辰抖动，万物悲鸣，孔子羽化而成仙，头顶《论语》、《春秋》、《礼》、《乐》，一股浓郁“仁爱”之气萦绕，成就圣贤之位。
“仁，亲也。”
“仁者，情志好生爱人，故立字二人为仁。”
“上下相亲谓之仁。”
“温良者，仁之本也。”
“仁者，谓其中心欣然爱人也。”
“仁者，可以观其爱焉。”
一股浩浩荡荡的清波，哗啦啦作响，澄净无垢，恍若银河倒挂，飞流直下三千尺。孔子鹤发童颜、白须三尺，手握竹简，脚踏清波，吟诵诗书而行。
浩浩荡荡三千里至仁至爱清气汇聚成一股洪流，不知其宽，弥漫周天，随着孔子抑扬顿挫的念诵《诗经》而不断掀起朵朵浪花。
半空之中显露出一鲲一人来。
“夫子，贫道有礼了。”
孔子见到庄周，停下吟诵，上前拱手道：“许久未见，庄先生到时风采依旧啊！”
庄周言道：“夫子才是神采奕然得天独厚，在人间功德圆满，身死而羽化，不渡天劫而成仙道，真乃可喜可贺也！”
孔子知道自己可谓是得天独厚，三皇五帝不可追，谁知居然死后能够凭借教化之德羽化成仙，得长生之道。
孔丘苦笑不已，道：“老夫德行浅薄，在人间一无所成，幸蒙上天垂怜，得以闻圣贤之书而得道，实在惭愧呀！”
一时之间紫气东来三万里，瑞气千条，紫气弥漫，一个虎背熊腰的释教之人驾着千叶七宝莲台而来。